摩托车发动机可以通过改变进气系统、排气系统、点火系统、燃油系统等来提升性能。还可以进行缸体改装、涡轮增压、增加氮气或氧气输入、调整传动比例等来改善动力输出。此外,还可以进行平衡轴调整、润滑系统升级、散热系统改进等来提高发动机的稳定性和耐久性。